Dem Generalsekretariat obliegt die Administration von LDK und KOLAS. Das Generalssekretariat organisiert die Sitzungen der Konferenzen und der Vorstände, protokolliert diese und stellt den Informationsfluss zwischen der LDK, der KOLAS und anderen Fachkonferenzen aus dem Bereich der Agrarverwaltung, den Vertretung in der Konferenz der Sekretäre der Konferenzen (KoSeKo) und weiteren Gremien der Konferenz der Kantonsregierungen (KdK). Ein wichtiger und grosser Teil der Arbeit ist das Vorbereiten und Beschaffung von Entscheidungsgrundlagen für das Verfassen von Vernehmlassungen und Stellungnahmen.
Das Generalsekretariat befindet sich im Haus der Kantone, Speichergasse 6, 3001 Bern.
